La famille de Rohan adopte la reforme protestante. Richelieu, le ministre de Louis XIII, va faire détruire le donjon et certaines tours. Pendant trois siècles, la famille ne viendra plus au château de Josselin. Lors de la Révolution, le monument devient une prison et un siège de l’administration. Au XVII ème, Marguerite de Rohan, héritière de la famille épouse Henri Chabot, tout en négocient le droit de garder son nom, son titre et sa fortune, en échange de revenir à la religion catholique. Le château n’est plus que l’ombre de lui même au XIX ème siècle, quand le 11 ème duc Alain de Rohan et son épouse Herminie entreprendront une grande restauration néo-gothique.