Lors de la guerre de cent ans, le capitaine de Château du Loir : Amaury de Trôo, pille et incendie l’abbaye en 1364. En 1383 des pilleurs soldats harcèlent toujours les moines, ils quittent l’abbaye pour se réfugier au château de la Motte Sonzay. La Clarté Dieu restera une grande victime de ces attaques et ne s’en remit jamais complétement. Malgré leurs richesses et les reconstructions, elle ne retrouvera pas sa grandeur. C’est au XIX ème que fût construit le logis abbatial. Lorsque la révolution sépare l’église et l’état en 1789 c’est la fin des abbayes. Le site servira de carrière pour les constructions environnantes, d’exploitation agricole et les caves seront des champignonnières. En 2002 lorsque les ruines de l’abbaye se cachent derrière la végétation, un couple de passionnés achètent le lieu dans le but de le restaurer et de l’entretenir.